ChemBook — Cahier de Labo

ChemBook

Lab Morin

🔍

🧪 Le saviez-vous ?

L'odeur si caractéristique de la terre après la pluie, appelée « pétrichor », provient en grande partie d'une seule molécule : la géosmine, produite par des bactéries du sol. Notre nez y est extraordinairement sensible, capable de la détecter à quelques dizaines de parties par billion, soit une performance olfactive remarquable pour une trace aussi infime.

😄 La blague du jour

Quel est le point commun entre un boomerang et une mauvaise blague ? Elle revient toujours ! 🪃

📓

Cahier de Labo

🧬

Molécules

📋

Inventaire

📰

Publications

🔗

Publi. Partagées

📁

Documents

Cahier de Labo

Type de réaction

Année

Mois

Molécule

Projet

Rendement min (%)

Nouvelle Réaction

Remplissez la fiche et les calculs se font automatiquement

📌 Informations générales

Nom de la réaction *

⚠️ Ce nom est déjà utilisé

Type de réaction

Date

Tags (séparés par virgules)

Molécule produite (lier à la bibliothèque)

🔗 Étape précédente (rendement multi-étapes)

Projet

🔒 Réaction privée (visible uniquement par moi)

🖼️ Schéma de réaction (ChemDraw)

🧪

Glissez votre image ChemDraw ici
ou cliquez pour parcourir
ou Coller (Ctrl+V / ⌘V)

⚗️ Réactifs & Réactants

Le réactif limitant (SM) sert de référence pour les équivalents. Entrez sa masse molaire et sa quantité en mmol, ou sa masse en g (ex: 1.5 g) — ajouter mg pour des milligrammes (ex: 500 mg).

	Composé	Rôle	MM (g/mol)	Éq.	Pur. %	mmol	Masse	Vol. (mL)	ρ (g/mL) ou C (M)

📦 Stock en temps réel

🏆 Produit obtenu

❌ Réaction échouée (aucun produit obtenu)

Nb. ballons

—

mmol théoriques

—

masse théorique

—

Rendement

📝 Observations / Notes

🧪 Colonne / Column

Système / System

Taille de colonne / Column size

Éluant A / Eluent A

Éluant B / Eluent B

Gradient

Durée totale / Total duration

Produit sorti à / Product eluted at

% Éluant B à la sortie / % Eluent B at elution

🔬 Chromatographie sur couche mince (CCM)

Ajoutez une ou plusieurs photos de CCM.

🧴 Éluant

Rf (optionnel)

🔬

Glissez vos photos CCM ici
ou cliquez pour parcourir
ou Coller (Ctrl+V / ⌘V)

📸 Photos de la réaction

Ajoutez des photos du montage, des étapes, du produit…

📸

Glissez vos photos ici
ou cliquez pour parcourir
ou Coller (Ctrl+V / ⌘V)

🔬 Spectre(s) RMN

Ajoutez une image du spectre et/ou un fichier brut (.mnova, .jdf, .dx…)

📚 Références & Fichiers

Lien de publication inspirante

Citation / Référence

Fichier(s) à joindre (procédure, spectre brut, données…)

📁 Glisser un fichier ou cliquer

—

Nos Molécules

Bibliothèque de toutes les molécules synthétisées

Nouvelle Molécule

Ajoutez une molécule à la bibliothèque

🧬 Informations générales

Nom de la molécule *

Formule brute

Masse molaire (g/mol)

Projet

Tags

🏁 Molécule finale (cible atteinte)

CAS

Notes

🧬 SMILES

🔒 Sécurité

Entrez un CAS et cliquez 🔍 dans les informations générales pour importer depuis PubChem.

Densité (g/mL)

—

Éb (°C)

—

Éf (°C)

—

Signal

—

Mentions H

—

Codes P

—

🖼️ Structure de la molécule

🧬

Image de la structure (ChemDraw, ORTEP…)
ou cliquez pour parcourir

Les mesures de rendement quantique s'ajoutent depuis la section 🔆 Rendement Φ de la barre latérale.

Nos Publications

Articles de l'équipe et références clés

Nouvelle Publication

📰 Informations générales

Titre *

Auteurs

Journal

Année

Volume / Pages

DOI / Lien

Tags

Résumé / Notes

🖼️ Image de couverture

📄

Screenshot de l'entête ou image de couverture
ou cliquez pour parcourir

📎 Fichiers

Article (PDF)

📄 Glisser le PDF ou cliquer

Supporting Information (PDF)

📄 Glisser le SI ou cliquer

🧬 Molécules de cette publication

Sélectionnez les molécules de votre bibliothèque synthétisées dans ce papier.

Mes Documents

PDF, présentations, tableurs et autres fichiers

Nouveau Document

📁 Informations

Titre *

Type

Tags

Description / Notes

📎 Fichier

📁

Glisser le fichier ici ou cliquer pour parcourir

PDF, PPT, Excel, Word, ZIP…

Publi. Partagées

Articles partagés entre membres de l'équipe

Nouvelle Publication partagée

📰 Informations générales

Titre *

Auteurs

Journal

Année

Volume / Pages

DOI / Lien

Thème

Tags

Résumé / Notes

Partagé par

🖼️ Image de couverture

📄

Screenshot de l'entête ou image de couverture
ou cliquez pour parcourir

📎 Fichiers

Article (PDF)

📄 Glisser le PDF ou cliquer

Supporting Information (PDF)

📄 Glisser le SI ou cliquer

📋 Inventaire

Produits commerciaux du laboratoire

🔍

🔬 Recherche par structure

SMILES

Structure
apparaîtra ici structure preview

Tanimoto ≥ 80%

Nom	CAS	Formule	MM (g/mol)	Quantité	Fournisseur	Emplacement	Date d'ajout	Restant	Inventaire

Nouveau produit

Nom *

Nom français

CAS

Formule

MM (g/mol)

Quantité

Fournisseur

Adresse postale du fournisseur

Emplacement

Pureté

Densité (g/mL)

Concentration (M)

Seuil d'alerte(même unité que la quantité restante)

Pt d'ébullition (°C)

Pt de fusion (°C)

Masse exacte (g/mol)

Date de réception

Mention de danger

Codes GHS (séparés par -)

Codes H – Mentions de danger

Codes P – Conseils de prudence

URL Fiche de sécurité (SDS)

Stockage

Noms alternatifs

SMILES

Nombre de contenants Crée autant d'entrées identiques dans l'inventaire

📋

Rapport hebdomadaire requis

Semaine du

à exporter.

Ce rapport sera également sauvegardé dans ChemBook pour garantir la traçabilité de vos données.

Modélisation

Génère les fichiers d'entrée Gaussian (.com / .gjf) et de soumission (.sh, SLURM) à partir d'une géométrie

1 · Molécule

Glisse un fichier ici ou clique pour parcourir

.xyz · .mol2 · .log / .out (Gaussian)

2 · Méthode de calcul

Type de job

Mode diradical (gap singulet–triplet)

Préréglage : BS-DFT · B3LYP-D3(BJ)/def2-TZVP

Génère 2 jeux de fichiers : triplet (UDFT, mult 3, opt freq) et singulet broken-symmetry (UDFT, mult 1, opt + guess=mix stable=opt). La fonctionnelle est préfixée « U » automatiquement. Charge, base, dispersion et solvant sont repris des champs ci-dessous ; les types de job et la multiplicité manuels sont ignorés dans ce mode.

Gap S–T — dépose les deux .log une fois les calculs finis

🔴 Triplet .log

glisser ou cliquer

🔵 Singulet BS .log

glisser ou cliquer

Options TD-DFT

nstates

root (état suivi)

États

Options NICS — sondes fantômes Bq

Cycles détectés (clique pour ajouter / retirer) :

NICS(0) au centre NICS hors-plan distance (Å) des deux côtés (±)

Centroïde et normale du cycle calculés automatiquement. Les Bq sont ajoutés à la fin des coordonnées.

Fonctionnelle / méthode

Base

Charge

Multiplicité

Dispersion empirique

Solvant (PCM)

Mots-clés supplémentaires (ajoutés à la ligne de route)

%mem

%nprocs

Temps SLURM (DD-HH:MM)

Module Gaussian

Nom du job (.com/.gjf / .sh / .chk)

--mem SLURM ≈ 2× %mem (auto). Tout est éditable.

3 · Fichiers générés

.com

.sh

Charge une molécule pour générer les fichiers.

Extension

EPR — ΔE_S-T

Gap singulet–triplet expérimental par RPE en température variable (VT-EPR), ajustement de Bleaney-Bowers

Molécule cible

1 · Série de spectres VT

Glisse tous les fichiers de la série ou clique

.xml ESRStudio (T et Q lus auto) · ou .csv / .txt / .xlsx (2 colonnes : champ, signal → renseigne les températures ci-dessous)

Normaliser par le facteur Q Ligne de base : % aux bords

Plage d'intégration (champ) : →

Fichiers CSV/XLSX — températures de la série (°C) : T début T fin Intervalle

2 · Intensités intégrées

Fichier	T (K)	Q	I	(I/Q)·T
Aucun fichier chargé.

3 · Gap singulet–triplet

Charge au moins 4 températures pour l'ajustement.

Rendement Quantique

Molécule cible

Rattacher le résultat à une molécule ChemBook

Référence

Préréglage

Φ référence

λ excitation (nm)

Solvants

Solvant référence

n =

Solvant échantillon

n =

Absorption

Référence

📂

Glisser (plusieurs fichiers OK)

Échantillon

📂

Glisser (plusieurs fichiers OK)

Séparateur :

Chaque fichier = une concentration. Format 2 colonnes (λ, absorbance). L'ordre doit correspondre aux fichiers d'émission.

Émission

Référence

📂

Glisser (plusieurs fichiers OK)

Plage :→nm

Échantillon

📂

Glisser (plusieurs fichiers OK)

Plage :→nm

Chaque fichier = une concentration. Format 2 colonnes (λ, intensité). Vide = tout le spectre.

Rendement quantique Φ

—

Série	Fichier abs.	Fichier émission	A (λexc)	Aire émission

⚙️ Paramètres

Personnalisez votre espace de travail

Mon espace

🏛️ Équipe

Nom du groupe

Institution

🔐 Partage des réactions privées

Sélectionnez un membre à qui partager vos réactions privées (ex: votre directeur de recherche).

Partager avec

🔔 Notifications

Soyez alerté lorsque de nouvelles publications partagées sont ajoutées.

Listes personnalisables

⚗️ Types de réactions

Ces types apparaissent dans le formulaire de réaction. Les types par défaut ne peuvent pas être supprimés.

🔬 Noyaux RMN

Ajoutez des noyaux RMN supplémentaires.

📦 Emplacements inventaire

Ces emplacements apparaissent dans le formulaire d'inventaire. Les emplacements par défaut ne peuvent pas être supprimés.

🏷️ Thèmes de publications partagées

Ces thèmes permettent de classer les publications partagées par catégorie.

📁 Projets

Créez des projets pour organiser vos réactions et molécules.

Intégrations

🔖 Bookmarklet web

Importez des publications depuis n'importe quel site en un clic. Générez une clé, puis installez le bookmarklet.

📰 Ouvrir l'installeur

Générez d'abord une clé, puis ouvrez l'installeur pour configurer le bookmarklet.

🧪 Bibliothèque

Composés enregistrés — utilisés pour l'autocomplétion

Nom	CAS	Formule	MM (g/mol)	ρ (g/mL)	C (M)

🧪

Aucun composé enregistré

Les composés s'ajoutent automatiquement à la sauvegarde d'une réaction.

🛡️ Administration

Gestion des utilisateurs et des accès

🖼️ Image de la page d'accueil

Image affichée en hero sur la page d'accueil de l'application.

📋 Mode inventaire (cases Présent / Étiquette)

Quand activé, deux cases « Présent » et « Étiquette » apparaissent à côté de chaque produit de l'inventaire. Tout le monde peut cocher (synchronisé entre appareils). Permet ensuite de supprimer les produits non présents et de lister les étiquettes à refaire.

Activer le mode inventaire

⏳ Demandes en attente

✅

Aucune demande en attente

👥 Utilisateurs actifs

📦 Export complet des réactions

Génère un PDF contenant toutes les réactions d'un membre depuis le début, dans l'ordre chronologique.

Ou générer un PDF pour chaque membre d'un coup :